Disciplina Bioinformática

O crescimento rápido da rede internet fornece à informação um território de expansão que facilita também a difusão das ferramentas informáticas. Serão apresentados os bancos de dados bioinformáticos e os programas disponíveis para o seu tratamento. Os princípios teóricos (biológicos e matemáticos) sobre os quais estes tratamentos são baseados serão igualmente abordados.

Não aplicável

1. Introdução à Bioinformática. Definição. Evolução e árvore filogenética do mundo vivo. Macromoléculas e informática. Principais organizações de Bioinformática. 2. Bases de dados. Aspectos técnicos. Bases de dados principais. 3. Análise e comparação de sequências. Modelos de substituição de nucleótidos. Similaridade entre sequências. Métodos de comparação de sequências e distância evolutiva. Alinhamentos de sequências. Programas e noções de base. 4. Análise filogenética. Modelos de árvores filogenéticas. Métodos de construção de árvores. Testes estatísticos (Bootstrap) e programas. 5. Análise estrutural de macromoléculas. Evolução das proteínas. Previsão das estruturas. Classificação das proteínas. Determinação da estrutura das biomoléculas. Recursos e programas. 6. Genomas, proteomas, transcriptomas. Genomas (sequenciação, anotação, comparação, farmacogenética). Proteomas (electroforese bidimensional, espectrometria de massa). Transcriptomas (microarrays).

O carácter essencialmente prático desta UC destina-se a desenvolver no estudante um saber fazer indispensável na sua futura carreira.

- Graur D. & Li W.-H. (2000). Fundamentals of molecular evolution. Sinauer, Sunderland. - Voet D. & Voet. J.G. (2010). Biochemistry, 4th Ed. John Wiley & Sons, New York.